論文・著書リスト

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Last update: Apr. 4, 2017
Sano T., Kawata K., Ohno S., Yugi K., Kakuda H., Kubota H., Uda S., Fujii M., Kunida K., Hoshino D., Hatano A., Ito Y., Sato M., Suzuki Y., and Kuroda S.
Selective control of up-regulated and down-regulated genes by temporal patterns and doses of insulin.
Sci. Signal., 9(455): ra112, 2016.

Yugi K., Kubota H., Hatano A., and Kuroda S.
Trans-Omics: How To Reconstruct Biochemical Networks Across Multiple 'Omic' Layers.
Trends Biotechnol., 34(4): 276-290, 2016.

Fukuda S., Nishida-Fukuda H., Nanba D., Nakashiro K., Nakayama H., Kubota H., and Higashiyama S.
Reversible interconversion and maintenance of mammary epithelial cell characteristics by the ligand-regulated EGFR system.
Sci. Rep., 6: 20209, 2016.
Katsura Y., Kubota H., Kunida K., Kuroda S., and Ozawa T.
An optogenetic system for interrogating the temporal dynamics of Akt.
Sci. Rep., 5: 14589, 2015.

Ohashi K., Komada H., Uda S., Kubota H., Iwaki T., Fukuzawa H., Komori Y., Fujii M., Toyoshima Y., Sakaguchi K., Ogawa W., and Kuroda S.
Glucose Homeostatic Law: Insulin Clearance Predicts the Progression of Glucose Intolerance in Humans.
PLoS ONE, 10(12): e0143880, 2015.
Noguchi R., Kubota H., Yugi K., Toyoshima Y., Komori Y., Soga T., and Kuroda S.
The Selective Control of Glycolysis, Gluconeogenesis and Glycogenesis by Temporal Insulin Patterns.
Mol. Syst. Biol., 9: 664, 2013.

Uda S., Saito T., Kudo T., Kokaji T., Tsuchiya T., Kubota, H., Komori Y., Ozaki Y., and Kuroda, S.
Robustness and compensation of information transmission of signaling pathways.
Science, 34(6145): 558-561, 2013.

Akimoto Y., Yugi K., Uda S., Komori Y., Kubota H., and Kuroda S.
The extraction of simple relationships in growth factor-specific multiple-input and multipleoutput systems in cell-fate decisions by backward elimination PLS regression.
PLoS ONE, 8(9): e72780, 2013.

Kubota H., and Kuroda S.
シグナル伝達機構による時間情報コード
生物物理, 53(4): 184-189, 2013.
Kubota H., Noguchi R., Toyoshima Y., Ozaki Y., Uda S., Watanabe K., Ogawa W., and Kuroda S.
Temporal Coding of Insulin Action through Multiplexing of the AKT Pathway.
Mol. Cell, 46: 820-832, 2012.
Fujita K., Toyoshima Y., Uda S., Ozaki Y., Kubota H., and Kuroda S.
Decoupling of Receptor and Downstream Signals in the Akt Pathway by Its Low-Pass Filter Characteristics.
Sci. Signal., 3(132): ra56, 2010.

Ozaki Y., Uda S., Saito T., Chung J., Kubota H., and Kuroda S.
A quantitative image cytometry technique for time series or population analyses of signaling networks.
PLoS ONE, 5(4): e9955, 2010.

Chung J., Kubota H., Ozaki Y., Uda S., and Kuroda, S.
Timing-Dependent Actions of NGF Required for Cell Differentiation.
PLoS ONE, 5(2): e9011, 2010.

Matsuo R., Kubota H., Obata T., Kito K., Ota K., Kitazono T., Ibayashi S., Sasaki T., Iida M., and Ito T.
The yeast eIF4E-associated protein Eap1p attenuates GCN4 translation upon TOR inactivation.
FEBS Lett., 579: 2433-2438, 2005.

Ichimura T., Kubota H., Goma T., Mizushima N., Ohsumi Y., Iwago M., Kakiuchi K., Shekhar H. U., Shinkawa T., Taoka M, Ito T., and Isobe T.
Transcriptomic and proteomic analysis of a 14-3-3 gene-deficient yeast.
Biochemistry, 43: 6149-6158, 2004.

Kubota H., Obata T., Ota K., Sasaki T., and Ito T.
Rapamycin-induced translational derepression of GCN4 mRNA involves a novel mechanism for activation of the eIF2α kinase GCN2.
J. Biol. Chem., 278: 20457-20460, 2003.

Ito T., Ota K., Kubota H., Yamaguchi Y., Chiba T., Sakuraba K., and Yoshida M.
Roles for the two-hybrid system in exploration of the yeast protein interactome.
Mol. Cell. Proteomics, 1: 561-566, 2002.

Kubota H., Ota K., Sakaki Y., and Ito T.
Budding yeast GCN1 binds the GI domain to activate the eIF2α kinase GCN2.
J. Biol. Chem., 276: 217591-217596, 2001.

Kubota H., Sakaki Y., and Ito T.
GI domain-mediated association of the eukaryotic initiation factor 2α kinase GCN2 with its activator GCN1 is required for general amino acid control in budding yeast.
J. Biol. Chem., 275: 20243-20246, 2000.
柚木克之、久保田浩行、黒田真也
トランスオミクスによる生化学ネットワーク再構築―疾患は多階層生化学ネットワークの破綻である
実験医学増刊, 35(2): 212-218, 2017.

久保田浩行
システム生物学―数理科学を用いる「いろは」とめざすもの
実験医学増刊, 35(5): 46-52, 2017.
柚木克之、久保田浩行、黒田真也
トランスオミクス研究の新展開 ― 階層統合の最新動向、そして次に来るもの ―
実験医学, 34(11): 1787-1793, 2016.

久保田浩行、黒田真也
トランスオミクス解析が暴き出す相互作用ネットワークの全体像
医学のあゆみ, 259(8): 843-848, 2016.
Hiroyuki, K. and Kuroda, S.
Temporal Coding of Insulin Signaling
Protein modification in pathogenic dysregulation of signaling (Springer), 95-109, 2015.

柚木克之、久保田浩行、黒田真也
トランスオミクス解析:マルチオミクスデータから代謝制御ネットワークを再構築する
バイオサイエンスとインダストリー, 73: 392-394, 2015.

久保田浩行、柚木克之、黒田真也
トランスオミクス解析 ― 次なるシグナリング研究を担えるか!?
実験医学増刊, 33(10): 190-196, 2015.
柚木克之、久保田浩行、黒田真也
トランスオミクスによる代謝制御ネットワークの再構築
実験医学, 32(8): 1215-1222, 2014.
野口怜、久保田浩行、黒田真也
インスリン作用の時間情報コード
糖尿病学2013, 2013.
久保田浩行、黒田真也
細胞シグナリングの情報処理機構
改訂第3版 分子生物学イラストレイテッド, 289-294, 2009.
九州大学 生体防御医学研究所
統合オミクス分野
教授 久保田 浩行